La fistule anale a pour origine l'infection des glandes d'Herman et Desfosses. Elle représente environ 70% des suppurations de la région anale et périanale. Les autres suppurations sont représentées par le sinus pilonidal qui est une infection au niveau du sillon interfessier avec un écoulement se produisant au niveau de petits orifices de ce sillon appelé fossette par où ressort parfois des touffes de poils ; il existe également une maladie appelée maladie de Verneuil dont l'origine semble être une infection au niveau des tiges pilaires et qui n'a également aucun rapport avec le canal anal. On peut trouver également des fissures anales infectées, des lésions suppurées de la maladie de Crohn, des fistules recto-vaginales, des glandes sous-pectinéales etc…